Kromě běžného očkovacího kalendáře (včetně MMR) se doporučuje hepatitida A a břišní tyfus, u delších pobytů i hepatitida B. Očkování proti žluté zimnici se vyžaduje jen při příjezdu ze země s rizikem přenosu.
Malárie se vyskytuje po celém ostrově kromě samotného Antananarivu, protimalarická profylaxe se doporučuje pro všechny oblasti. Riziko dengue je taky celoplošné, přenašeči jsou komáři aktivní přes den. Ojediněle se vyskytuje i mor (dýmějový/plicní) v odlehlejších venkovských oblastech, poslední větší výskyt byl v roce 2017.
Zdravotnictví je i na africké poměry podprůměrné, kvalitnější soukromá péče je dostupná jen v Antananarivu. U vážnějších případů se jednoznačně doporučuje letecká evakuace (nejčastěji na Réunion nebo do JAR).
Dovoz léků s obsahem opiátů a silných sedativ je regulovaný, doporučuje se vozit je v originálním balení s lékařskou zprávou nebo receptem.